Arthrobacter gandavensis

Le genre Arthrobacter appartient à la classe des Actinobacteria, à la sous-classe des Actinobacteridae, à l'ordre des Actinomycetales, au sous-ordre des Micrococcineae et à la famille des Micrococcaceae. Il est constitué de bactéries non sporulées, parfois mobiles, aérobies strictes, à métabolisme respiratoire, catalase positive, se présentant comme des bacilles de forme irrégulière et parfois ramifiés durant la phase exponentielle de croissance et sous la forme de cellules coccoïdes durant la phase stationnaire de croissance. Les Arthrobacter sp. retiennent la coloration de Gram mais ils peuvent se décolorer facilement voire même apparaître à Gram négatif dans les jeunes cultures. En fonction de la structure du peptidoglycane, les Arthrobacter sp. sont divisés en deux groupes : les espèces possédant un peptidoglycane du type A3alpha (voir le fichier "Classification des peptidoglycanes selon Schleifer et Kandler") et les espèces possédant un peptidoglycane du type A4alpha (voir le fichier "Classification des peptidoglycanes selon Schleifer et Kandler"). L'habitat principal des arthrobactéries est constitué par le sol mais certaines espèces peuvent être isolées de biotopes différents. . Arthrobacter albus, Arthrobacter creatinolyticus, Arthrobacter cumminsii, Arthrobacter luteolus, Arthrobacter oxydans et Arthrobacter woluwensis sont isolés de divers prélèvements humains (infections urinaires, infections de la peau, sang, otites, liquide amniotique, cervicites, plaies, ostéomyélites...). Arthrobacter cumminsii semble l'espèce la plus fréquemment impliquée lors d'infections chez l'homme. . Arthrobacter citreus est isolé des fèces de volailles mais cette espèce est sans doute un contaminant d'origine tellurique. . Arthrobacter protophormiae est isolé d'un diptère (Protophormia tarraenovae) et du sol. . Arthrobacter ilicis est responsable d'une maladie du houx (Ilex opaca). . Seules trois espèces présentent un intérêt en biologie vétérinaire : Arthrobacter rhombi décrit en 1999, Arthrobacter nasiphocae décrit en 2002 et Arthrobacter gandavensis. La nomenclature de Arthrobacter gandavensis a été validement publiée le 13 novembre 2003 pour trois souches provenant de trois bovins appartenant à des élevages différents. Deux souches ont été isolées de mammite et une souche de l'utérus. Selon Storms et al., le pouvoir pathogène de cette espèce demeure cependant incertain. Ces trois souches présentent les caractères phénotypiques du genre Arthrobacter. Les séquences de leurs ARNr 16S présentent au moins 99,9 p. cent d'homologie et une analyse phylogénétique révèle une parenté avec Arthrobacter luteolus (98,6 p. cent d'homologie entre les séquences des ARNr 16S) et Arthrobacter citreus (97,2 p. cent d'homologie). En accord avec les conclusions de Stackebrandt et Goebel de tels pourcentages d'homologie ne permettent pas d'individualiser une nouvelle espèce ce qui a conduit Storms et al. à réaliser des hybridations ADN-ADN. Les résultats de cette étude montrent clairement que les trois souches d'origine bovine constituent une nouvelle espèce car les pourcentages d'homologie obtenues entre la souche LMG 21285 (souche type de Arthrobacter gandavensis) et les souches types de Arthrobacter luteolus et de Arthrobacter citreus sont inférieurs à 50 (voir le fichier " Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne"). Les souches de Arthrobacter gandavensis rassemblent des coccobacilles à Gram positif, de 0,5 à 1 µm de longueur, effilés à une de leur extrémité, non sporulés, mobiles, aérobies, catalase positive, non fermentatifs, possédant un peptidoglycane du type A3alpha. Les principaux caractères ont été étudiés à l'aide de galeries API Coryne, API 50CH et BBL Crystal Gram-positive ID (voir le fichier " Galerie "BBL Crystal® Identification Systems Gram-positive ID Kit"). . Une réponse positive est notée pour les tests nitrate réductase, hydrolyse de l'esculine, pyrazinamidase, bêta-galactosidase, alpha-glucosidase, uréase, L-phénylalanine-AMC, 4MU-bêta-D-glucoside, arginine, p-nitrophényl alpha-D-galactoside, p-nitrophényl bêta-D-glucoside, proline & leucine-p-nitroanilide, p-nitrophényl phosphate, 4MU-phosphate et acidification faible du fructose et du ribose. . Une réponse variable selon les souches est observée pour les tests hydrolyse de la gélatine, L-arginine-AMC, L-acide pyroglutamique-AMC, L-tryptophane-AMC , 4MU-N-acétyl-bêta-D-glucosaminide, 4MU-phosphate, 4MU-bêta-D-glucuronide, acidification de l'esculine, du D-glucose, du mannose et du rhamnose. . La réponse aux autres tests est négative. Aucune culture n'est obtenue en anaérobiose ou en présence de 6,5 p. cent de NaCl. La présence de 5 p. cent de dioxyde de carbone ne stimule pas la croissance. Arthrobacter gandavensis cultive à 25, 30, 37 °C mais la croissance est faible à 42 °C. Les colonies obtenues sur une gélose Columbia enrichie de 5 p. cent de sang de mouton et incubée à 37 °C sont lisses, brillantes, circulaires, colorées en jaune, non hémolytiques et leur diamètre est d'environ 1 mm. En bouillon cœur-cervelle on note la présence d'un trouble et d'un sédiment. Les principaux caractères permettant de différencier Arthrobacter gandavensis des espèces pigmentées en jaune et phylogénétiquement apparentées sont donnés dans le tableau I. Orientation bibliographique COLLINS (M.D.), HOYLES (L.), FOSTER (G.), FALSEN (E.) et WEISS (N.) : Arthrobacter nasiphocae sp. nov., from the common seal (Phoca vitulina) Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 569–571. FUNKE (G.), HUTSON (R.A.), BERNARD (K.A.), PFYFFER (G.E.), WAUTERS (G.) et COLLINS (M.D.) : Isolation of Arthrobacter spp. from clinical specimens and description of Arthrobacter cumminsii sp. nov. and Arthrobacter woluwensis sp. nov. J. Clin. Microbiol., 1996, 34, 2356-2363. FUNKE (G.), PAGANO-NIEDERER (M.), SJODEN (B.) et FALSEN (E.) : Characteristics of Arthrobacter cumminsii, the most frequently encountered Arthrobacter species in human clinical specimens. J. Clin. Microbiol., 1998, 36, 1539-1543. 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