Bifidobacterium thermacidophilum subsp. porcinum

Créé le 30 septembre 2003

BIFIDOBACTERIUM THERMACIDOPHILUM SUBSP. PORCINUM

À la date du 30 septembre 2003, le genre Bifidobacterium* rassemble plus de 30 espèces et sous-espèces différentes (voir le fichier Bifidobacterium in List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature).
La nomenclature de Bifidobacterium thermacidophilum a été validement publiée le 11 janvier 2000 pour trois souches bactériennes isolées d'eaux usées.

Lors d'un travail ayant pour but de démontrer que le séquençage des gènes codant pour la protéine du choc thermique de 60 kDa (gène hsp60) pouvait se substituer aux homologies ADN-ADN**, Zhu et al. étudient 32 souches de Bifidobacterium isolées de l'homme et de diverses espèces animales (lapins, daims, bovins et porcs).
Les pourcentages d'homologie entre les séquences des ARNr 16S de deux souches isolées de fèces de porcelets et les séquences des souches types des espèces thermotrophes du genre Bifidobacterium (Bifidobacterium boum, Bifidobacterium thermacidophilum et Bifidobacterium thermophilum) sont égaux ou supérieurs à 97. Le pourcentage d'homologie le plus élevé (97,9) est noté entre les souches porcines et Bifidobacterium boum. Toutefois, les plus fortes homologies ADN-ADN (83 p. cent) et les plus fortes homologies de séquences des gènes hsp60 (97 p. cent) sont observées entre les souches porcines et Bifidobacterium thermacidophilum. Ces valeurs sont compatibles avec la reconnaissance d'une nouvelle sous-espèce.
Les deux souches isolées de porcelets présentent quelques caractères phénotypiques particuliers et Zhu et al. proposent de les placer dans la nouvelle sous-espèce Bifidobacterium thermacidophilum subsp. porcinum dont la nomenclature sera validement publiée le 12 septembre 2003.

La caractérisation de cette nouvelle sous-espèce, conduit Zhu et al. à modifier la description de Bifidobacterium thermacidophilum.
Les souches de Bifidobacterium thermacidophilum sont constituées de bacilles à Gram positif, de forme irrégulière, mesurant 0,5 µm de diamètre sur 3 à 8 µm de longueur, immobiles, non sporulés, anaérobies, fermentant le glucose sans formation de gaz en produisant de l'acide acétique et de l'acide lactique. La température optimale de croissance est comprise entre 37 et 41 °C mais une culture est observée pour des températures allant de 30 à 49,5 °C. Le pH optimal est de l'ordre de 7,0-7,2, mais la croissance est bonne pour un pH de 4,5 alors qu'elle est retardée pour un pH de 4,0.
Bifidobacterium thermacidophilum fermente l'amidon, le D-fructose, le galactose, le D-glucose, le glycogène, le maltose, le mélibiose, le saccharose, le D-raffinose et le D-turanose. Une réponse négative est notée pour la fermentation du mannitol, du rhamnose et du sorbose. La fermentation du L-arabinose, du gluconate, du méthyl alpha-D-glucoside, de l'inuline, du lactose, du D-mannose, du ribose, de la salicine du tréhalose et du xylose est variable selon les souches.
Le lait tournesolé n'est ni acidifié ni coagulé par la plupart des souches.

Bifidobacterium thermacidophilum subsp. porcinum ne peut cultiver à une température supérieure à 46,5 °C. Les souches de cette sous-espèce acidifient le tréhalose, mais elles n'acidifient ni le L-arabinose ni l'inuline ni le D-mannose.
Les principaux caractères permettant de différencier Bifidobacterium thermacidophilum subsp. porcinum des autres espèces et sous-espèces thermotrophes du genre Bifidobacterium sont donnés dans le tableau I.

Les deux souches actuellement décrites ont été isolées des fèces de porcelets.

BIAVATI (B.) et MATTARELLI (P.) : The family Bifidobacteriaceae. In : M. Dworkin et al., eds., The Prokaryotes: An Evolving Electronic Resource for the Microbiological Community, 3rd edition, release 3.7, 11/2/2001, Springer-Verlag, New York, http://link.springer-ny.com/link/service/books/10125/.

SCARDOVI (V.) : Genus Bifidobacterium Orla-Jensen 1924, 472AL. In: P.H.A. SNEATH, N.S. MAIR, M.E. SHARPE et J.G. HOLT (éds.) Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2, The Williams & Wilkins Co., Baltimore, 1986, pp. 1418-1434.

ZHU (L.), LI (W.) et DONG (X.) : Species identification of genus Bifidobacterium based on partial HSP60 gene sequences and proposal of Bifidobacterium thermacidophilum subsp. porcinum subsp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 1619-1623.