Bifidobacterium tsurumiense

Créé le 24 janvier 2008

BIFIDOBACTERIUM TSURUMIENSE

L'étude de la plaque dentaire de hamsters nourris durant six semaines avec une alimentation riche en sucres, a permis d'isoler plusieurs souches bactériennes non identifiées. Trois de ces souches, obtenues sur gélose CFAT*, ont été qualifiées de Bifidobacterium-like. En effet, elles ressemblent à des Bifidobacterium spp., mais elles sont capables de croître en aérobiose et elles possèdent un G + C p. cent de 53 (alors que le G + C p. cent des Bifidobacterium spp. est égal ou supérieur à 55).

L'analyse des séquences des ARNr 16S montre que ces trois souches appartiennent au genre Bifidobacterium** et que les espèces phylogénétiquement les plus proches sont Bifidobacterium boum, Bifidobacterium thermacidophilum, Bifidobacterium thermophilum, Bifidobacterium coryneforme, Bifidobacterium asteroides et Bifidobacterium indicum. Toutefois, les pourcentages de similarité obtenus entre la souche OMB115 (qui sera désignée comme la souche type de Bifidobacterium tsurumiense) et les souches types des espèces apparentées sont inférieurs ou égaux à 96,1 p. cent. De telles valeurs sont compatibles avec la description d'une nouvelle espèce ce qui conduit Okamoto et al. à proposer la nomenclature de Bifidobacterium tsurumiense qui sera validement publiée le 10 janvier 2008.

Les souches de Bifidobacterium tsurumiense sont constituées de courts bacilles ou de cocco-bacilles à Gram positif, aéro-anaérobies, catalase et oxydase négatives, synthétisant une fructose-6-phosphate phosphocétolase.

Les caractères biochimiques ont été étudiés à l'aide de galeries API 50 CHL (incubées 48 heures à 37 °C dans une atmosphère anaérobie), API Rapid ID 32A (incubées 4 heures dans une atmosphère aérobie) et de galeries API ZYM (incubées 4 heures dans une atmosphère aérobie).
. Un résultat positif est obtenu avec les tests hydrolyse de l'esculine, alanine arylamidase, alpha-arabinosidase, alpha-galactosidase, alpha-glucosidase, arginine arylamidase, bêta-galactosidase, bêta-glucosidase, cystéine arylamidase, estérase, estérase lipase, glycine arylamidase, histidine arylamidase, leucine arylamidase, leucyl glycine arylamidase, lipase, phosphatase acide, phénylalanine arylamidase, proline arylamidase, sérine arylamidase, tyrosine arylamidase, valine arylamidase, fermentation de l'amidon, de l'amygdaline, du L-arabinose, de l'arbutine, du cellobiose, du D-fructose, du D-galactose, du gentiobiose, du gluconate , du 2-cétogluconate, du méthyl alpha-D-glucopyranoside, du D-glucose, du glycogène, du D-lactose, du maltose, du D-mannitol, du D-mannose, du mélibiose, du raffinose, du D-ribose, du saccharose, de la salicine, du tréhalose, du turanose et du D-xylose.
. Une réponse négative est observée pour les tests réduction des nitrates, indole, uréase, arginine di-hydrolase, bêta-galactosidase-6-phosphate, bêta-glucuronidase, N-acetyl-bêta-glucosaminidase, acide glutamique décarboxylase, alpha-fucosidase, phosphatase alcaline, pyroglutamate arylamidase, glutamyl acide glutamique arylamidase, trypsine, chymotrypsine, phosphoamidase, alpha-mannosidase, alpha-fucosidase, fermentation du D-adonitol, du D-arabinose, du D-arabitol, du L-arabitol, du dulcitol, de l'érythritol, du D-fucose, du L-fucose, du 5-cétogluconate, de la N-acétylglucosamine, du glycérol, de l'inositol, de l'inuline, du D-lyxose, du méthyl alpha-D-mannopyranoside, du mélézitose, du L-rhamnose, du D-sorbitol, du L-sorbose, du D-tagatose, du méthyl bêta-D-xylopyranoside, du xylitol et du L-xylose.

La culture est obtenue pour des températures comprises entre 25 et 45 °C (température optimale 37 °C). Après 24 heures d'incubation en anaérobiose, les colonies sont blanches, rugueuses et légèrement convexes. Une culture est également obtenue sur le milieu LBS*** (Lactobacillus selective agar).

L'habitat de Bifidobacterium tsurumiense est la cavité buccale du hamster et les trois souches isolées par Okamoto et al. ont pour origine la plaque dentaire.

OKAMOTO (M.), BENNO (Y.), LEUNG (K.P.) et MAEDA (N.) : Bifidobacterium tsurumiense sp. nov., from hamster dental plaque. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2008, 58, 144-148.

SCARDOVI (V.) : Genus Bifidobacterium Orla-Jensen 1924, 472AL. In: P.H.A. SNEATH, N.S. MAIR, M.E. SHARPE et J.G. HOLT (éds.) Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2, The Williams & Wilkins Co., Baltimore, 1986, pp. 1418-1434.

STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.