Candidatus neoehrlichia mikurensis

Voir aussi les fichiers Anaplasmataceae et Groupes génomiques de la tribu des Ehrlichieae ou de la famille des Ehrlichiaceae ou de la famille des Anaplasmataceae. Notes : . Pour des renseignements complémentaires sur la catégorie Candidatus, voir l'entrée "Candidatus" in Glossaire de nomenclature bactérienne ou le fichier "Candidatus" in : List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature. . Bien que n'étant pas régi par les règles du Code de Nomenclature, le nom d'un Candidatus correspondant au rang d'espèce est généralement écrit, entre guillemets, de la manière suivante : Candidatus (écrit en italique avec la première lettre en capitale) + nom du genre (écrit en caractères romains avec la première lettre en capitale) + nom d'espèce (écrit en caractères romains avec la première lettre en minuscule). Exemple : "Candidatus Neoehrlichia mikurensis". L'appellation de "Candidatus Neoehrlichia mikurensis" a été proposée le 20 septembre 2004 par Kawahara et al. pour des bactéries mises en évidence au japon chez des rats sauvages (Rattus norvegicus) et des tiques (Ixodes ovatus). Ces bactéries ne sont pas cultivables in vitro mais elles peuvent être transmises à des rats de laboratoire de souche Wistar par injection intrapéritonéale d'un broyat de rate venant d'un animal infecté. La position phylogénétique de ces micro-organismes (une souche présente chez le rat sauvage et une souche mise en évidence dans un broyat de tiques) a été élucidée par le séquençage des ARNr 16S et par le séquençage des opérons groESL (13 paires de bases du gène groES, 91 paires de bases correspondant à l'espace intergénique et 1223 paires de bases du gène groEL). . L'analyse des séquences des ARNr 16S montre que les deux souches forment un groupe indépendant des Ehrlichia sp. et des Anaplasma sp. Ce groupe renferme également Ehrlichia sp. variant Schotti* mis en évidence chez Ixodes ricinus aux Pays Bas et une souche qualifiée de "Ehrlichia-like Rattus"** mise en évidence chez des rats (Rattus norvegicus) du district de Guangzhou (Chine). "Candidatus Ehrlichia walkerii"***, germe mis en évidence chez des tiques (Ixodes ricinus) prélevées sur des patients italiens, n'a pas été inclus dans l'étude car la séquence de son ARNr 16S est incomplète. . L'analyse des séquences des opérons groESL confirme les résultats précédents. Elle montre que les deux souches mises en évidence chez un rat et dans un broyat de tiques forment un groupe indépendant quasiment équidistant des Ehrlichia sp. et des Anaplasma sp. Les séquences des opérons groESL ne sont pas disponibles pour le variant Schotti, "Ehrlichia-like Rattus" et "Candidatus Ehrlichia walkerii", si bien que ces germes n'ont pu être inclus dans l'étude. Aucune communauté antigénique n'a été mise en évidence entre les deux souches étudiées par Kawahara et al. et les espèces des genres Anaplasma, Ehrlichia et Neorickettsia. Au vu de ces résultats, Kawahara et al. créent un nouveau genre et une nouvelle espèce qui, compte tenu de l'absence de culture in vitro, sont placés dans la catégorie Candidatus ("Candidatus Neoehrlichia mikurensis"). "Candidatus Neoehrlichia mikurensis" constitue un nouveau genre et une nouvelle espèce au sein de la famille des Anaplasmataceae. L'examen au microscope électronique de coupes de rates prélevées chez des rats naturellement infectés ou expérimentalement infectés permet de visualiser de petits coques enfermés dans des vacuoles intracytoplasmiques présentes dans les cellules endothéliales des sinus veineux. Les coques sont entourés par une paroi ayant la structure caractéristique d'une bactérie à Gram négatif. Avec Ehrlichia ruminantium et les Ehrlichia sp. souches HF****, "Candidatus Neoehrlichia mikurensis" est le troisième taxon de la famille des Anaplasmataceae capable d'infecter les cellules endothéliales. Orientation bibliographique DUMLER (J.S.), BARBET (A.F.), BEKKER (C.P.J.), DASCH (G.A.), PALMER (G.H.), RAY (S.C.), RIKIHISA (Y.) et RURANGIRWA (F.R.) : Reorganization of genera in the families Rickettsiaceae and Anaplasmataceae in the order Rickettsiales: unification of some species of Ehrlichia with Anaplasma, Cowdria with Ehrlichia and Ehrlichia with Neorickettsia, description of six new species combinations and designation of Ehrlichia equi and 'HGE agent' as subjective synonyms of Ehrlichia phagocytophila. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001, 51, 2145-2165. KAWAHARA (M.), RIKIHISA (Y.), ISOGAI (E.), TAKAHASHI (M.), MISUMI (H.), SUTO (C.), SHIBATA (S.), ZHANG (C.) et TSUJI (M.) : Ultrastructure and phylogenic analysis of 'Candidatus Neoehrlichia mikurensis' in the family Anaplasmataceae, isolated from wild rats and found in Ixodes ovatus ticks. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 1837-1843. * : Ehrlichia sp. variant Schotti. En 1999, Schouls et al. publient une étude portant sur des tiques (Ixodes ricinus) prélevées aux Pays Bas sur des chevreuils (Capreolus capreolus). Plus de 6 p. cent de ces tiques sont infectées par une bactérie inconnue que les auteurs appellent "Ehrlichia-like organism". Ultérieurement, ce nouveau germe sera désigné sous le nom de Ehrlichia sp. variant Schotti ou variant Schotti. Référence : SCHOULS (L.M.), VAN DE POL (I.), RIJPKEMA (S.G.) et SCHOT (C.S.) : Detection and identification of Ehrlichia, Borrelia burgdorferi sensu lato, and Bartonella species in Dutch Ixodes ricinus ticks. J. Clin. Microbiol., 1999, 37, 2215-2222. Retour ** : "Ehrlichia-like Rattus". "Ehrlichia-like Rattus" a été détectée chez trois rats capturés à proximité d'un élevage de chiens au sein duquel avait été mis en évidence des infections à Ehrlichia canis. L'analyse des ARNr 16S montre que "Ehrlichia-like Rattus" est apparentée au variant Schotti (99,03 p. cent d'homologie). Référence : La publication consacrée à "Ehrlichia-like Rattus" a été publiée dans une revue à laquelle l'auteur de ce fichier n'a pas accès. Toutefois, le résumé de la publication est disponible sur PubMed. PAN (H.), LIU (S.), MA (Y.), TONG (S.) et SUN (Y.) : Ehrlichia-like organism gene found in small mammals in the suburban district of Guangzhou of China. Ann. N. Y. Acad. Sci., 2003, 990, 107-111. Retour *** : "Candidatus Ehrlichia walkerii" "Candidatus Ehrlichia walkerii" a été découvert chez 10 tiques (Ixodes ricinus) prélevées chez des sujets apparemment sains, vivant dans la province de Belluno (Italie). L'analyse de la séquence des ARNr 16S et du gène gltA permet de rapprocher "Candidatus Ehrlichia walkerii" de Ehrlichia ruminantium. Références : Les publications originelles consacrées à "Candidatus Ehrlichia walkerii" ont été publiées dans une revue à laquelle l'auteur de ce fichier n'a pas accès. Toutefois, les résumés de ces publications sont disponibles sur PubMed. BROUQUI (P.), SANOGO (Y.O.), CARUSO (G.), MEROLA (F.) et RAOULT (D.) : Candidatus Ehrlichia walkerii: a new Ehrlichia detected in Ixodes ricinus tick collected from asymptomatic humans in Northern Italy. Ann. N. Y. Acad. Sci., 2003, 990, 134-140. SANOGO (Y.O.), PAROLA (P.), SHPYNOV (S.), CAMICAS (J.L.), BROUQUI (P.), CARUSO (G.) et RAOULT (D.) : Genetic diversity of bacterial agents detected in ticks removed from asymptomatic patients in northeastern Italy. Ann. N. Y. Acad. Sci., 2003, 990, 182-190. Retour **** Ehrlichia sp. souches HF. Les 14 premières souches HF ont été caractérisées par Fujita et Watanabe en 1994 chez des tiques japonaises (Ixodes ovatus). Malheureusement, la publication de ces auteurs est en japonais et un résumé de leur publication n'est pas disponible sur PubMed. Ultérieurement Shibata et al. montrent que les souches HF sont apparentées à Ehrlichia chaffeensis (98,2 p. cent d'homologie). L'inoculations intrapéritonéale d'une souche HF provoque la mort de souris BALB/c et la souche HF peut être mise en évidence dans les cellules endothéliales, dans les monocytes et dans les macrophages. Références : OKADA (H.), TAJIMA (T.), KAWAHARA (M.) et RIKIHISA (Y.) : Ehrlichial proliferation and acute hepatocellular necrosis in immunocompetent mice experimentally infected with the HF strain of Ehrlichia, closely related to Ehrlichia chaffeensis. J. Comp. Pathol., 2001, 124, 165-171. SHIBATA (S.), KAWAHARA (M.), RIKIHISA (Y.), FUJITA (H.), WATANABE (Y.), SUTO (C.) et ITO (T.) : New Ehrlichia species closely related to Ehrlichia chaffeensis isolated from Ixodes ovatus ticks in Japan. J. Clin. Microbiol., 2000, 38, 1331-1338. Retour