Lactobacillus kitasatonis

Créé le 25 novembre 2003

LACTOBACILLUS KITASATONIS

Lactobacillus acidophilus, initialement décrit par Moro en 1900 sous le nom de "Bacillus acidophilus", est une nomenclature retenue par les Approved Lists of Bacterial Names. En 1980, l'étude de 78 souches permet à Johnson et al. de montrer que cette espèce est constituée de six genomospecies (voir le fichier ¤ "Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne") désignées A1, A2, A3, A4, B1 et B2. La souche type ATCC 4356 est une souche de la genomospecies A1 qui constitue donc l'espèce Bacillus acidophilus sensu stricto. Les souches de la genomospecies A2 sont des synonymes de Lactobacillus crispatus, la genomospecies A3 est considérée comme un synonyme de Lactobacillus amylovorus et les souches des genomospecies A4, B1 et B2 ont été dénommées, respectivement, Lactobacillus gallinarum, Lactobacillus gasseri et Lactobacillus johnsonii.
Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus amylovorus, Lactobacillus crispatus, Lactobacillus gallinarum, Lactobacillus gasseri et Lactobacillus johnsonii sont souvent appelées les espèces du "groupe Lactobacillus acidophilus".

Les souches de Lactobacillus acidophilus, de Lactobacillus amylovorus, de Lactobacillus crispatus et de Lactobacillus gallinarum possèdent une couche cristalline de surface (S-layer) non retrouvée chez les souches de Lactobacillus gasseri et de Lactobacillus johnsonii. La couche cristalline de surface est constituée d'une unique protéine d'un poids moléculaire compris entre 43 000 et 46 000.
La protéine de la couche de surface des souches JCM 1038 et JCM 1039, isolées de la muqueuse de l'intestin grêle de poulets et étiquetées Lactobacillus acidophilus, a une structure originale ce qui a conduit Mukai et al. à supposer qu'elles n'étaient pas d'authentiques souches de Lactobacillus acidophilus.

L'étude des ribotypes, effectuée sur 62 souches appartenant au "groupe Lactobacillus acidophilus", révèle qu'elles se répartissent dans 14 groupes, A1 à A11 et B1 à B3. Les souches JCM 1038 et JCM 1039 forment le groupe A9 ce qui suggère qu'elles diffèrent de Lactobacillus acidophilus sensu stricto.

En 2003, Mukai et al. étudient les souches JCM 1038 et JCM 1039 ainsi que quatre souches (KM55, KM105, KM132 et KM9212) isolées de la muqueuse de l'intestin grêle de poulets et dont la protéine de la couche cristalline de surface est identique à celle des souches JCM 1038 et JCM 1039.
L'analyse de la séquence de l'ARNr 16S de la souche JCM 1039 (qui sera désignée comme la souche type de Lactobacillus kitasatonis) révèle qu'elle est apparentée à Lactobacillus amylovorus et, dans une moindre mesure, à Lactobacillus crispatus, à Lactobacillus gallinarum, à Lactobacillus helveticus et à Lactobacillus acidophilus. Les ADN des souches JCM 1038, JCM 1039, KM55, KM105, KM132 et KM9212 présentent plus de 77 p. cent d'homologie et ces six souches appartiennent à une seule genomospecies. Les pourcentages d'homologie ADN-ADN entre les souches JCM 1038, JCM 1039, KM9212 et les souches types des espèces phylogénétiquement apparentées sont inférieurs à 18. Les six souches isolées de la muqueuse intestinale de poulets constituent donc une nouvelle genomospecies pour laquelle Mukai et al. proposent la dénomination de Lactobacillus kitasatonis, nomenclature validement publiée le 13 novembre 2003.

Les souches de Lactobacillus kitasatonis présentent les caractères généraux du genre Lactobacillus*. Elles sont constituées de bacilles à Gram positif, de 0,6 à 1,0 µm de diamètre sur 2,0 à 20,0 µm de longueur, immobiles, non sporulés, se présentant de manière isolée ou groupés par deux ou parfois en courtes chaînes, aéro-anaérobies, catalase négative, acidifiant (sans gaz) le glucose et d'autres sucres en produisant de l'acide DL-lactique, ne coagulant pas le lait, cultivant à 45 °C mais pas à 15 °C.
Les autres caractères bactériologiques font l'objet d'une description très succincte. En utilisant des galeries API 50CH, les souches acidifient l'esculine, le fructose, le galactose, le glucose, le maltose, le mannnose et le saccharose. Lactobacillus kitasatonis n'acidifie ni l'amygdaline ni l'arabinose ni le mélibiose ni le mélézitose ni le raffinose ni le ribose ni le sorbitol ni le tréhalose ni le xylose.
Quelques caractères permettant de différencier Lactobacillus kitasatonis des espèces apparentées sont donnés dans le tableau I.
Après deux jours d'incubation en anaérobiose et à 37 °C, les colonies obtenues sur gélose MRS** sont convexes, opaques, rugueuses, blanches, à contour régulier ou légèrement irrégulier et leur diamètre varie de 1,2 à 2,1 mm.

Toutes les souches ont été isolées de la muqueuse de l'intestin grêle de poulets. Les souches KM55, KM105, KM132 et KM9212 ont été isolées en anaérobiose sur gélose LBS*** (Lactobacillus selection agar). Aucun pouvoir pathogène et aucun effet bénéfique (probiotique) n'ont été attribués à Lactobacillus kitasatonis.

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