Proteobacteria, alphaproteobacteria, betaproteobacteria, gammaproteobacteria, deltaproteobacteria, epsilonproteobacteria

Le phylum des "Proteobacteria" ainsi que les classes des Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Deltaproteobacteria et Epsilonproteobacteria sont décrits dans le volume 2, parties B et C, de la seconde édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. À l'exception du phylum des "Proteobacteria", rang taxonomique non couvert par les règles du Code de Nomenclature, toutes ces nomenclatures seront validement publiées par citation dans les listes de validation 106 et 107. Tous ces taxons sont définis uniquement sur la base des analyses phylogénétiques déduites de l'étude des séquences des ARNr 16S. . Le phylum des "Proteobacteria" regroupe des prokaryotes très divers, mais descendant d'un ancêtre commun et qui présentent des séquences d'ARNr 16S apparentées à celles des représentants de l'ordre des Pseudomonadales (ordre type du phylum). . La classe des Alphaproteobacteria rassemble des bactéries dont les séquences des ARNr 16S sont apparentées à celles des membres de l'ordre des Caulobacterales (ordre type de la classe). . La classe des Betaproteobacteria accueille des bactéries dont les séquences des ARNr 16S sont apparentées à celles des membres de l'ordre des Burkholderiales (ordre type de la classe). . La classe Gammaproteobacteria est constituée par les bactéries dont les séquences des ARNr 16S sont apparentées à celles des membres de l'ordre des Pseudomonadales (ordre type de la classe). . La classe des Deltaproteobacteria renferme des bactéries dont les séquences des ARNr 16S sont apparentées à celles des membres de l'ordre des Myxococcales (ordre type de la classe). . La classe des Epsilonproteobacteria rassemble des bactéries dont les séquences des ARNr 16S sont apparentées à celles des membres de l'ordre des Campylobacterales (ordre type de la classe). Le phylum des "Proteobacteria", ne doit pas être confondu avec la classe des Proteobacteria décrite en 1988 par Stackebrandt et al. Stackebrandt et al. plaçaient dans la classe des Proteobacteria quatre sous-classes désignées par les noms vernaculaires de Alpha, Beta, Gamma et Delta. Le phylum des "Proteobacteria" est l'un des 24 phylums du domaine (ou empire) des "Bacteria" (ou "Eubacteria"). La liste des principaux ordres, familles et genres d'intérêt vétérinaire, inclus dans ce phylum, est donnée ci-dessous. Certaines nomenclatures n'ont pas encore fait l'objet d'une publication valide mais, à l'exception de l'ordre des "Enterobacteriales", de l'ordre des "Vibrionales" et de la famille des "Aurantimonadaceae", ces noms vont figurer prochainement dans des listes de validation. Phylum des "Proteobacteria" Classe des Alphaproteobacteria

Famille des Aurantimonadaceae Genre Aurantimonas Famille des Bartonellaceae Genre Bartonella Famille des Bradyrhizobiaceae Genre Afipia Famille des Brucellaceae Genres Brucella et Ochrobactrum

Ordre des Rickettsiales Famille des Rickettsiaceae Genres Orientia et Rickettsia Famille des Anaplasmataceae Genres Anaplasma, Aegyptianella, Cowdria, Ehrlichia et Neorickettsia Classe des Betaproteobacteria Ordre des Burkholderiales Famille des Burkholderiaceae Genre Burkholderia Famille des Alcaligenaceae Genres Bordetella, Brackiella, Pelistega, Sutterella et Taylorella Famille des Oxalobacteraceae Genre Janthinobacterium Ordre des Neisseriales Famille des Neisseriaceae Genres Alysiella, Chromobacterium, Kingella, Laribacter, Neisseria, Simonsiella et Uruburuella Classe des Gammaproteobacteria

Ordre des Thiotrichales Famille des Francisellaceae Genre Francisella Famille des Piscirickettsiaceae Genre Piscirickettsia Ordre des Legionellales Famille des Legionellaceae Genre Legionella Famille des Coxiellaceae Genre Coxiella Ordre des Pseudomonadales Famille des Pseudomonadaceae Genre Pseudomonas Famille des Moraxellaceae Genres Acinetobacter, Moraxella et Psychrobacter Ordre des Oceanospirillales Famille des Halomonadaceae Genres Carnimonas et Halomonas Famille des Oceanospirillaceae Genre Marinomonas Ordre des Alteromonadales Famille des Alteromonadaceae Genre Alteromonas Famille des Colwelliaceae Genre Thalassomonas Famille des Moritellaceae Genre Moritella Famille des Pseudoalteromonadaceae Genre Pseudoalteromonas Famille des Shewanellaceae Genre Shewanella Famille Incertae sedis Genre Teredinibacter Ordre des "Vibrionales" Famille des Vibrionaceae Genres Enterovibrio, Grimontia, Photobacterium et Vibrio

Ordre des Aeromonadales Famille des Aeromonadaceae Genre Aeromonas Famille des Succinivibrionaceae Genre Anaerobiospirillum Ordre des "Enterobacteriales" Famille des Enterobacteriaceae Genres Buttiauxella, Citrobacter, Edwardsiella, Enterobacter, Escherichia, Hafnia, Klebsiella, Moellerella, Morganella, Plesiomonas, Proteus, Providencia, Raoultella, Salmonella, Serratia, Shigella, Trabulsiella et Yersinia Ordre des Pasteurellales Famille des Pasteurellaceae Genres Actinobacillus, Avibacterium, Gallibacterium, Haemophilus, Histophilus, Lonepinella, Mannheimia, Nicoletella, Pasteurella, Phocoenobacter et Volucribacter Classe des Deltaproteobacteria

Classe des Epsilonproteobacteria Ordre des Campylobacterales Famille des Campylobacteraceae Genres Arcobacter et Campylobacter Famille des Helicobacteraceae genre Helicobacter Orientation bibliographique BRENNER (D.J.), KRIEG (N.R.), STALEY (J.T.) et GARRITY (G.M.) (éds) : Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part A (Introductory Essays), Springer, New York, 2005, 304 pages. BRENNER (D.J.), KRIEG (N.R.), STALEY (J.T.) et GARRITY (G.M.) (éds) : Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), Springer, New York, 2005, 1106 pages. BRENNER (D.J.), KRIEG (N.R.), STALEY (J.T.) et GARRITY (G.M.) (éds) : Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, second edition, vol. 2 (The Proteobacteria), part C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria), Springer, New York, 2005, 1256 pages. LAPAGE (S.P.), SNEATH (P.H.A.), LESSEL (E.F.), SKERMAN (V.B.D.), SEELIGER (H.P.R.) et CLARK (W.A.) : International Code of Nomenclature of Bacteria (1990 Revision). American Society for Microbiology, Washington, D.C., 1992. STACKEBRANDT (E.), MURRAY (R.G.E.) et TRÜPER (H.G.) : Proteobacteria classis nov., a name for the phylogenetic taxon that includes the "purple bacteria and their relatives". Int. J. Syst. Bacteriol., 1988, 38, 321-325.