Psychrobacter faecalis

Psychrobacter faecalis est la dixième espèce décrite au sein du genre Psychrobacter*. Cette nomenclature a été proposée dans le numéro d'avril 2002 de Systematic and Applied Microbiology pour une unique souche bactérienne (la souche Iso-46 = DSM 14664 = CIP 107288), puis validement publiée le 11 septembre 2002 par inscription sur la liste de validation n° 87. L'ARNr 16S de la souche Iso-46 présente 95,6 p. cent d'homologie avec l'ARNr 16S de la souche type de Psychrobacter immobilis (espèce type du genre) et les pourcentages d'homologie obtenus avec les autres souches types des diverses espèces du genre Psychrobacter n'excèdent pas 96,9 p. cent. En accord avec les données établies par Stackebrandt et Goebel, ces valeurs sont compatibles avec la reconnaissance d'une nouvelle genomospecies (voir le fichier Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne). Comme les caractères phénotypiques permettent de différencier la souche Iso-46 des autres espèces du genre Psychrobacter, Kämpfer et al. créent la nouvelle espèce Psychrobacter faecalis. La souche Iso-46 se présente sous la forme de bacilles à Gram négatif, de 0,8 à 1,2 µm de diamètre sur 1 à 2 µm de longueur, immobiles, non sporulés, aérobies, oxydase et catalase positives, chimio-organotrophes, n'acidifiant pas les sucres. . Une réponse positive est obtenue pour les tests assimilation de la N-acétyl-D-galactosamine, de la N-acétyl-D-glucosamine, du L-arabinose, du D-glucose, de l'acétate, du propionate, du cis-aconitate, du 4-aminobutyrate, du citrate, du fumarate, du glutarate, du DL-3-hydroxybutyrate, du DL-lactate, du L-malate, du 2-oxoglutarate, du pyruvate, de la L-alanine, du L-aspartate, de la L-leucine et de la L-ornithine. . Une réponse négative est notée pour les tests indole, citrate de Simmons, uréase, LDC, ODC, ADH, production d'hydrogène sulfuré, assimilation du 3-hydroxybenzoate, du 4-hydroxybenzoate, de l'azélate, de la L-phénylalanine et de 31 autres substrats dont la liste figure dans l'article de Kämpfer et al. La croissance est possible pour des températures comprises entre 4 et 36 °C (température optimale de croissance comprise entre 15 et 30 °C) ; elle est également possible en présence de 2,0 M de NaCl ou en présence de 5 p. cent de bile. Après 48 heures d'incubation à 30 °C, les colonies obtenues sur gélose nutritive sont circulaires, opaques, légèrement bombées, à contour régulier et de couleur beige (pigment non diffusible et non fluorescent). Une croissance est obtenue sur gélose de MacConkey n° 3 (Oxoid) mais pas sur une gélose Salmonella-Shigella. Psychrobacter faecalis est la seule espèce du genre à assimiler la N-acétyl-D-glucosamine. L'absence d'acidification des sucres la distingue de Psychrobacter immobilis, de Psychrobacter pacificensis et de Psychrobacter proteolyticus. La possibilité de croître à 36 °C la distingue de Psychrobacter frigidicola, de Psychrobacter glacincola, de Psychrobacter proteolyticus et de Psychrobacter urativorans. Contrairement à Psychrobacter faecalis, Psychrobacter phenylpyruvicus (espèce apte à cultiver à 36 °C et n'acidifiant pas les sucres) ne tolère pas une concentration de 2,0 M de NaCl et elle hydrolyse l'urée. L'habitat de Psychrobacter faecalis n'est pas connu avec certitude. L'unique souche de cette espèce a été isolée d'un aérosol engendré par la manipulation de fèces de pigeons. Orientation bibliographique JUNI (E.) et HEYM (G.A.) : Psychrobacter immobilis gen. nov., sp. nov.: genospecies composed of Gram-negative, aerobic, oxidase-positive coccobacilli. Int. J. Syst. Bacteriol., 1986, 36, 388-391. KÄMPFER (P.), ALBRECHT (A.), BUCZOLITS (S.) et BUSSE (H.J.) : Psychrobacter faecalis sp. nov., a new species from a bioaerosol originating from pigeon faeces. Syst. Appl. Microbiol., 2002, 25, 31-36. STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849. * : Le genre Psychrobacter Le genre Psychrobacter et l'espèce Psychrobacter immobilis ont été proposés en 1986 pour des souches bactériennes isolées de l'eau de mer, de la peau et des branchies des poissons, des volailles, de produits carnés (même après irradiation, congélation ou dessiccation) et de divers prélèvements comme du pus. La description originelle du genre Psychrobacter est la suivante : Coccobacilles ou bacilles à Gram négatif, de 0,9 à 1,3 µm de diamètre sur 1,5 à 3,8 µm de longueur, parfois renflés, immobiles, non sporulés, aérobies, catalase et oxydase positives, sensibles à la pénicilline, non pigmentés, généralement capables de cultiver à 5 °C, généralement incapables de cultiver à 37 °C, ayant un optimum thermique de croissance d'environ 20 °C, donnant des colonies lisses et opaques sur une gélose cœur-cervelle. Le genre Psychrobacter est classé dans la famille des Moraxellaceae (voir le fichier Taxonomic scheme: Taxa included in the categories above the rank of genus in List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature). Les références des publications décrivant les diverses espèces du genre sont données dans le fichier Psychrobacter in List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature. Retour