Thalassomonas, thalassomonas viridans

En 1994, Ortigosa et al. ont publié une étude de taxonomie numérique portant sur 245 souches de bacilles à Gram négatif, aérobies stricts, isolées soit de l'eau soit d'huîtres des côtes méditerranéennes (sud de la région de Valence, Espagne). Les résultats* ont permis d'identifier plusieurs taxons déjà décrits ainsi que des phénons non encore caractérisés. C'est ainsi que deux souches, préalablement rapprochées des Alteromonas sp. ont été placées par Ortigosa et al. dans le phénon 29. Ces souches ont fait l'objet d'études complémentaires dont les résultats ont conduit à proposer la description d'un nouveau genre et d'une nouvelle espèce, Thalassomonas viridans. Les séquences des ARNr 16S de ces deux souches sont pratiquement identiques (plus de 99,8 p. cent d'homologie) et une analyse phylogénétique permet de les placer dans la sous-division gamma des Proteobacteria a proximité du genre Colwellia (93,2 à 94,8 p. cent d'homologie) et dans une moindre mesure des genres Idiomarina et Glaciecola. Les souches isolées par Ortigosa et al. diffèrent également des Colwellia sp. par la valeur de leur G + C p. cent (48,4 pour la future souche type de Thalassomonas viridans contre 35 à 42 pour les espèces du genre Colwiella) et par leurs caractères phénotypiques. Pour ces différentes raisons, Macián et al. regroupent ces deux souches au sein d'une même espèce incluse dans un nouveau genre et ils proposent les nomenclatures de Thalassomonas et de Thalassomonas viridans qui seront validement publiées en juillet 2001. Le genre Thalassomonas regroupe des bacilles à Gram négatif, de 1,5 à 2 µm de longueur sur 0,8 à 1 µm de diamètre, mobiles grâce à un unique flagelle polaire, aérobies stricts, incapables de fermenter les sucres, chimio-organotrophes, catalase et oxydase positives, halophiles, mésophiles (croissance pour des températures comprises entre 13 et 37 °C mais absence de croissance à 4 ou à 40 °C), possédant principalement des acides gras non ramifiés et saturés ou mono-insaturés, hydrolysant la gélatine, la caséine, l'amidon et la lécithine, donnant une réponse négative aux tests réduction des nitrates, production d'indole, hydrolyse de l'alginate, hydrolyse de l'agar, arginine di-hydrolase, lysine décarboxylase et ornithine décarboxylase. L'hydrolyse du Tween 80 est négative sauf si l'incubation est prolongée durant plus de sept jours. Thalassomonas viridans nécessite des facteurs de croissance et les tests d'assimilation doivent être effectués en ajoutant 1 g/L d'extraits de levure au milieu de base de Baumann et al.**. Les résultats de ces tests sont les suivants : . Assimilation de l'amygdaline, du cellobiose, de la L-citrulline, de la glutamine, de l'histidine, du propionate et de la L-tyrosine. . Croissance faible dans un milieu contenant du D-fructose, du fumarate, du D-glucose, de la L-leucine, ou du maltose comme unique source de carbone et d'énergie. . Absence d'assimilation de l'acétate, de l'aconitate, de la L-alanine, du gamma-aminobutyrate, du L-arabinose, de l'arbutine, du p-hydroxybenzoate, de l'alpha-cétoglutarate, du citrate, du D-galactose, du D-galacturonate, du D-gluconate, du glycérate, du glycérol, de la glycine, de la N-acétyl-D-glucosamine, du D-glucuronate, du L-glutamate, du m-inositol, du DL-lactate, du lactose, du DL-malate, du D-mannitol, du D-mannose, du mélibiose, de la putrescine, du L-rhamnose, du saccharate, de la salicine, de la sarcosine, de la L-sérine, du D-sorbitol et du D-xylose. . L'assimilation de la L-arginine, du DL-bêta-hydroxybutyrate, de la L-ornithine, du D-ribose, du succinate et de la L-thréonine est variable selon les souches. . Dans la publication de Macián et al., à deux reprises (page 1285 et 1288), l'assimilation du saccharose est notée comme étant un caractère faiblement positif ou, trois lignes plus bas, comme un caractère négatif ! La croissance nécessite du NaCl et, dans le milieu "Marine broth", elle est observée pour des concentrations de NaCl atteignant 4 p. cent. En revanche, aucune culture ne se développe lorsque la concentration en sel est supérieure ou égale à 6 p. cent. Après incubation à 24-26 °C, les colonies obtenues sur le milieu "Marine agar" sont opaques, à contour régulier, non luminescentes et aucun envahissement du milieu n'est noté. Dans le milieu "Marine broth" la croissance se traduit par un voile important en surface alors que le reste du milieu demeure limpide. Aucune croissance n'est observée sur la gélose TCBS***. À des températures d'incubation comprises entre 13 et 30 °C, les souches de Thalassomonas viridans produisent un pigment vert bleu dont la couleur s'estompe dès la 48ème heure. La production de ce pigment n'est pas observée lorsque la culture est effectuée à 37 °C. Thalassomonas viridans se distingue facilement des espèces du genre Colwellia qui sont aéro-anaérobies et psychrophiles. Comme Thalassomonas viridans, les Glaciecola sp. et les Idiomarina sp. sont des espèces aérobies stricts. Toutefois, les Glaciecola sp. produisent un pigment rose ou rouge, elles sont psychrophiles (croissance à 4 °C mais absence de croissance à 30 °C), elles cultivent en présence de 6 p. cent de NaCl, elles n'hydrolysent pas la gélatine et elles n'assimilent ni le fructose ni le maltose. Quant aux espèces du genre Idiomarina, elles sont non pigmentées, capables de croître à 4 °C ou en présence de 6 p. cent de NaCl, elles hydrolysent le Tween 80 (en moins de sept jours), elles n'assimilent ni le fructose ni le maltose mais elles assimilent la L-alanine. Les deux souches de Thalassomonas viridans, isolées par Ortigosa et al., proviennent d'huîtres méditerranéennes. Aucun pouvoir pathogène n'a été décrit pour cette espèce. Orientation bibliographique MACIÁN (M.C.), LUDWIG (W.), SCHLEIFER (K.H.), GARAY (E.) and PUJALTE (M.J.): Thalassomonas viridans gen. nov., sp. nov., a novel marine g-proteobacterium. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2001, 51, 1283-1289. ORTIGOSA (M.), GARAY (E.) et PUJALTE (M.J.) : Numerical taxonomy of aerobic, Gram-negative bacteria associated with oysters and surrounding seawater of the Meditrranean coast. Syst. Appl. Microbiol., 1994, 17, 589-600. * Les résultats obtenus montrent une grande diversité des souches isolées. Les 245 souches se répartissent en 46 phénons dont plusieurs correspondent à des taxons non identifiés. Les souches identifiées appartiennent (ou sont apparentées) à l'une des espèces suivantes : Alteromonas macleodii, Cyclobacterium marinum, Halomonas aquamarina, Halomonas cupida, Halomonas elongata, Halomonas pacifica, Marinobacter hydrocarbonoclasticus, Marinomonas vaga, Oceanospirillum linum, Pseudoalteromonas atlantica, Pseudoalteromonas citrea, Pseudoalteromonas espejiana, Pseudoalteromonas haloplanktis, Pseudoalteromonas luteoviolacea, Pseudoalteromonas undina, Pseudomonas fluorescens, Roseobacter denitrificans, Salegentibacter salegens, Shewanella putrefaciens, Stappia stellulata. Retour ** Les souches du phénon 29, actuellement dénommées Thalassomonas viridans, décrites dans la publication de Ortigosa et al. ne nécessitaient pas de facteurs de croissance. Les résultats des tests d'assimilation, obtenus par ces auteurs et réalisés sur le milieu de Baumann et al. sans extraits de levure, présentent de nombreuses différences par rapport aux résultats de Macián et al. Milieu de Baumann et al. (en g/L) D'après : . BAUMANN (L.), BAUMANN (P.) et MANDEL (M.) : Taxonomy of marine bacteria: the genus Beneckea. J. Bact., 1971, 107, 268-294. . BAUMANN (L.), BAUMANN (P.), MANDEL (M.) et ALLEN (R.D.) Taxonomy of aerobic marine eubacteria. J. Bact., 1972, 110, 402-429. . IVANOVA (E.) : Communication personnelle (4 septembre 2001). NH4Cl : 1.0 K2HPO4 : 0.075 FeSO4 : 0.028 Eau de mer artificielle (en g/L : NaCl : 23,4 - MgSO4, 7H2O : 24,6 - KCl : 1,5 - CaCl2, 2H2O : 2,9) : 500 ml Eau distillée : 500 ml Retour *** Gélose TCBS : Thiosulfate Citrate Bile salt Sucrose Extraits de levure : 0,5 p. cent (poids/volume) Peptone : 1,0 p. cent (poids/volume) Thiosulfate de sodium : 1,0 p. cent (poids/volume) Citrate de sodium : 1,0 p. cent (poids/volume) Bile de bœuf : 0,8 p. cent (poids/volume) Saccharose : 2,0 p. cent (poids/volume) NaCl : 1,0 p. cent (poids/volume) Citrate de fer : : 0,1 p. cent (poids/volume) Bleu de bromothymol : 0,004 p. cent (poids/volume) Bleu de thymol : 0,004 p. cent (poids/volume) Agar : 1,4 p. cent (poids/volume) pH : 8,6 Porter à ébullition pour dissoudre les ingrédients. Ne pas autoclaver. Retour