Bizionia
Description
Bizionia et Bizionia paragorgiae sont les nomenclatures validement publiées le 11 janvier 2005 pour une souche bactérienne, la souche KMM 6029, isolée d'un corail (Paragorgia arborea*) récolté dans la baie de Makarov (île d'Iturup, archipel des Kouriles, mer d’Okhotsk, Océan pacifique).
L'analyse de l'ARNr 16S de la souche KMM 6029 montre qu'elle appartient à la famille des Flavobacteriaceae. Au sein de cette famille, l'espèce phylogénétiquement la plus proche est Formosa algae. Toutefois, le pourcentage d'homologie obtenu entre les ARNr 16S de la souche KMM 6029 et de la souche type de Formosa algae est égal à 95,5.
En accord avec les conclusions de Stackebrandt et Goebel, la souche KMM 6029 constitue une genomospecies distincte (voir le fichier "Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne"), appartenant à un nouveau genre.
La souche KMM 6029 possède des caractères phénotypiques permettant de la différencier des autres représentants de la famille des Flavobacteriaceae ce qui permet à Nedashkovskaya et al. de décrire le nouveau genre Bizionia et la nouvelle espèce Bizionia paragorgiae.
Le genre Bizionia est constitué de bacilles à Gram négatif, non sporulés, immobiles, aérobies, produisant un pigment caroténoïde non diffusible, chimio-organotrophes, oxydase positive, catalase positive, phosphatase alcaline positive, n'acidifiant pas les sucres.
Outre les caractères du genre, Bizionia paragorgiae présente les caractères suivants.
. Le diamètre des cellules varie de 0,4 à 0,5 µm et leur longueur est comprise entre 1,9 et 2,3 µm.
. Une réponse positive est obtenue pour les tests production d'hydrogène sulfuré, hydrolyse de la caséine, hydrolyse de la gélatine, hydrolyse du tween 40 et hydrolyse du Tween 80.
. Une réponse négative est obtenue avec les tests nitrate réductase, uréase, indole, VP, hydrolyse de l'agar, hydrolyse de l'amidon, hydrolyse de la cellulose, hydrolyse de la chitine, hydrolyse du Tween 20, DNase, assimilation du L-arabinose, du citrate, du D-glucose, de l'inositol, du D-lactose, du malonate, du mannitol, du D-mannose, du saccharose et du sorbitol.
. Les principaux caractères permettant de distinguer le genre Bizionia des autres genres de la famille des Flavobacteriaceae sont donnés dans le fichier Caractères bactériologiques permettant de différencier les genres de la famille des Flavobacteriaceae.
. Une croissance est obtenue pour des températures comprises entre 4 et 36 °C (optimum 23-25 °C) et pour des concentrations en NaCl variant de 1 à 8 p. cent.
Sur le milieu Marine Agar 2216, incubé à 28 °C, les colonies sont circulaires, jaunes, brillantes, à contour régulier et leur diamètre est compris entre 2 et 4 mm.
Orientation bibliographique
NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), LYSENKO (A.M.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.) et BAE (K.S.) : Bizionia paragorgiae gen. nov., sp. nov, a novel member of the family Flavobacteriaceae isolated from the soft coral Paragorgia arborea. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 375-378.
STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
* Paragorgia arborea (corail "bubblegum")
Classification d'après le NCBI Taxonomy Browser : Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Cnidaria ; Anthozoa ; Alcyonaria ; Gorgonacea ; Scleraxonia ; Paragorgiidae ; Paragorgia ; Paragorgia arborea
Pour une photographie de cette espèce, voir Paragorgia arborea (Linnaeus) in Invertebrate Zoology (Yale University) ou Coral Story (page 3) in Le monde intertidal en direct, Écologie marine et sujets connexes (Virtual Museum, Canada).
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