Gramella
Description
Gramella et Gramella echinicola sont les nomenclatures validement publiées le 11 janvier 2005 pour une souche bactérienne, la souche KMM 6050, isolée d'un oursin (Strongylocentrotus intermedius*) récolté dans le golf Pierre le Grand (Baie de Troitsa, Mer du Japon).
L'analyse de l'ARNr 16S de la souche KMM 6050 montre qu'elle est un représentant de la famille des Flavobacteriaceae. Au sein de cette famille, les espèces phylogénétiquement les plus proches sont Mesonia algae et Salegentibacter salegens. Toutefois, les pourcentages d'homologie obtenus entre les ARNr 16S de la souche KMM 6050 et des souches types de Mesonia algae et de Salegentibacter salegens sont inférieurs à 92,6.
En accord avec les conclusions de Stackebrandt et Goebel, la souche KMM 6050 constitue une genomospecies distincte (voir le fichier "Définitions d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne"), appartenant à un nouveau genre.
La souche KMM 6050 possède des caractères phénotypiques permettant de la différencier des autres représentants de la famille des Flavobacteriaceae ce qui permet à Nedashkovskaya et al. de décrire le nouveau genre Gramella et la nouvelle espèce Gramella echinicola.
Le genre Gramella est constitué de bacilles à Gram négatif, non sporulés, mobiles par glissement, aérobies, produisant un pigment caroténoïde non diffusible, chimio-organotrophes, oxydase positive, catalase positive et phosphatase alcaline positive.
Outre les caractères du genre, Gramella echinicola présente les caractères suivants.
. Le diamètre des cellules varie de 0,5 à 0,7 µm et leur longueur est comprise entre 2,1 et 2,7 µm.
. Une réponse positive est obtenue pour les tests ONPG, DNase, hydrolyse de l'amidon, hydrolyse de la caséine, hydrolyse des Tween 40 et 80, hydrolyse de la gélatine, acidification du D-galactose, du D-glucose, du D-maltose, du L-raffinose et du saccharose, assimilation du L-arabinose, du D-glucose et du saccharose.
. Une réponse négative est obtenue avec les tests nitrate réductase, production d'hydrogène sulfuré, production d'indole, VP, uréase, hydrolyse de l'agar, hydrolyse de la chitine, hydrolyse de la cellulose, hydrolyse du Tween 20, acidification de l'adonitol, du L-arabinose, du D-cellobiose, du dulcitol, du L-fucose, du glycérol, de l'inositol, du D-lactose, du mannitol, du D-mélibiose, du L-rhamnose et du DL-xylose, assimilation du citrate, de l'inositol, du D-lactose, du malonate, du D-mannose, du mannitol et du sorbitol.
. Les principaux caractères permettant de distinguer le genre Gramella des autres genres de la famille des Flavobacteriaceae sont donnés dans le fichier Caractères bactériologiques permettant de différencier les genres de la famille des Flavobacteriaceae.
. Une croissance est obtenue pour des températures comprises entre 4 et 37 °C (optimum 23-25 °C) et pour des concentrations en NaCl variant de 1 à 15 p. cent.
Sur le milieu Marine Agar 2216, incubé à 28 °C, les colonies sont circulaires, de couleur jaune orangée, brillantes, à contour régulier et leur diamètre est compris entre 2 et 4 mm.
Orientation bibliographique
NEDASHKOVSKAYA (O.I.), KIM (S.B.), LYSENKO (A.M.), FROLOVA (G.M.), MIKHAILOV (V.V.), BAE (K.S.), LEE (D.H.) et KIM (I.S.) : Gramella echinicola gen. nov., sp. nov, a novel halophilic bacterium of the family Flavobacteriaceae isolated from the sea urchin Strongylocentrotus intermedius. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 391-394.
STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.
* : Strongylocentrotus intermedius
Classification d'après le NCBI Taxonomy Browser : Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Deuterostomia ; Echinodermata ; Eleutherozoa ; Echinozoa ; Echinoidea ; Euechinoidea ; Echinacea ; Echinoida ; Strongylocentrotidae ; Strongylocentrotus, Strongylocentrotus intermedius.
Strongylocentrotus intermedius fait l’objet d’une récolte commerciale, notamment dans les mers de Chine, du Japon, d’Okhotsk et de Béring. Cette espèce est un modèle d'étude en biologie du développement et une substance antitumorale et immunosuppressive, la 3'-sulphonoquinovosyl 1'-monoacylglycéride, a été extraite de son intestin.
Pour une photographie de cette espèce, voir http://www.fishexp.pref.hokkaido.jp/exp/saibai/Uniasp.htm
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