Halomonas

Créé le 16 octobre 2002
Dernière mise à jour le 08 février 2003

HALOMONAS

Autres dénominations :
Onze espèces du genre Halomonas correspondent à de nouvelles combinaisons. Les anciennes nomenclatures sont données dans le fichier Halomonas in List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature.

Voir aussi les fichiers : ¤ Oceanospirillales, Halomonadaceae et ¤ Halomonas aquamarina, Oceanospirillaceae.

Le genre Halomonas a été proposé en 1980 pour accueillir des bacilles à Gram négatif, mobiles, aéro-anaérobies, halotolérants, pouvant supporter jusqu'à 32 p. cent de NaCl. À l'origine, ce genre était réduit à son espèce type, Halomonas elongata.
En 1988, Franzmann et al. placent les genres Halomonas et Deleya au sein de la famille des Halomonadaceae*.

Entre les années 1987 et 1995, le genre Halomonas s'enrichit de cinq espèces : trois nouvelles espèces (Halomonas halodurans, Halomonas subglaciescola et Halomonas meridiana) et deux nouvelles combinaisons [Halomonas halmophila ("basonyme" Flavobacterium halmophilum) et Halomonas eurihalina ("basonyme" Volcaniella eurihalina)].

En 1996, l’étude des séquences des ARNr 16S montre que les genres Deleya, Halomonas et Halovibrio, ainsi que l’espèce Paracoccus halodenitrificans, forment un unique genre qui, en raison des règles de priorité, doit être appelé Halomonas.
Par la suite, de nouvelles espèces ont été décrites et Halomonas marina a été transférée dans le genre Cobetia sous la forme d'une nouvelle combinaison, Cobetia marina. Aussi, à la date du 29 novembre 2002, ce genre renferme 22 espèces (voir le fichier Halomonas in List of Procaryotic Names with Standing in Nomenclature).

Le genre Halomonas, dont la description a été modifiée en 1996, rassemble des bacilles à Gram négatif, droits ou incurvés, généralement mobiles (grâce à la présence de flagelles polaires ou d'une ciliature péritriche), aérobies (mais quelques souches sont capables de croître en anaérobiose en présence de nitrates), chimio-organotrophes, modérément halophiles (la croissance est optimale en présence de 0,3 à 2,0 M de NaCl mais certaines souches tolèrent jusqu'à 5,5 M de NaCl).
Ce genre se caractérise également par ses quinones respiratoires, par sa composition en acides gras et par la présence, dans son ARNr 16S, de six séquences signatures qui s'ajoutent aux 13 séquences signatures communes aux membres de la famille des Halomonadaceae.
Pour Romanenko et al., toutes les espèces du genre Halomonas ne sont pas conformes à la description donnée ci-dessus et, sur la base des caractères phénotypiques et des analyses phylogénétiques, ce genre devrait être scindé en plusieurs genres.

Le genre Halomonas intéresse peu la médecine vétérinaire à l’exception de ¤ Halomonas aquamarina et, dans une moindre mesure, de Halomonas halocynthiae.

La nomenclature de Halomonas halocynthiae a été validement publiée le 11 septembre 2002 pour une unique souche bactérienne isolée des branchies d'une ascidie (Halocynthia aurantium**) récoltée à trois mètres de profondeur dans la mer du Japon ou mer de l'Est, près des côtes de la Russie.
Halomonas halocynthiae diffère de la plupart des espèces du genre Halomonas par son immobilité, par la présence d'une capsule et par la présence de fimbriae. Pour Romanenko et al., ces caractéristiques seraient le signe d'une adaptation écologique.

DOBSON (S.J.) et FRANZMANN (P.D.) : Unification of the genera Deleya (Baumann et al. 1983), Halomonas (Vreeland et al. 1980), and Halovibrio (Fendrich 1988) and the species Paracoccus halodenitrificans (Robinson and Gibbons 1952) into a single genus, Halomonas, and placement of the genus Zymobacter in the family Halomonadaceae. Int. J. Syst. Bacteriol., 1996, 46, 550-558.

FRANZMANN (P.D.), WEHMEYER (U.) et STACKEBRANDT (E.): Halomonadaceae fam. nov., a new family of the class Proteobacteria to accommodate the genera Halomonas and Deleya. Syst. Appl. Microbiol., 1988, 11, 16-19.

LEE (I.H.), LEE (Y.S.), KIM (C.H.), KIM (C.R.), HONG (T.), MENZEL (L.), BOO (L.M.), POHL (J.), SHERMAN (M.A.), WARING (A.) et LEHRER (R.I.) : Dicynthaurin: an antimicrobial peptide from hemocytes of the solitary tunicate, Halocynthia aurantium. Biochim. Biophys. Acta, 2001, 1527, 141-148.

ROMANENKO (L.A.), KALINOVSKAYA (N.I.) et MIKHAILOV (V.V.) : Taxonomic composition and biological activity of microorganisms associated with a marine ascidian Halocynthia aurantium. Biologiya Morya, Vladivostok, 2001, 27, 334-339 (résumé en anglais disponible sur Internet).

ROMANENKO (L.A.), SCHUMANN (P.), ROHDE (M.), MIKHAILOV (V.V.) and STACKEBRANDT (E.): Halomonas halocynthiae sp. nov., isolated from the marine ascidian Halocynthia aurantium. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1767-1772.

VREELAND (R.H.), LITCHFIELD (C.D.), MARTIN (E.L.) et ELLIOT (E.) : Halomonas elongata, a new genus and species of extremely salt-tolerant bacteria. Int. J. Syst. Bacteriol., 1980, 30, 485-495.