Vitellibacter, vitellibacter vladivostokensis

Le genre Vitellibacter et l'espèce Vitellibacter vladivostokensis sont les nomenclatures validement publiées le 12 septembre 2003 pour une souche bactérienne (la souche KMM 3516) isolée de l'intestin d'un concombre de mer (Apostichopus ou Stichopus japonicus*) pêché dans le golf Pierre le Grand (Baie de Troitsa, Mer du Japon). Les caractères phénotypiques, la présence d'une ménaquinone à 6 unités isoprénoïdes, la composition des acides gras et la valeur du G + C p. cent (41,3) suggéraient que la souche KMM 3516 était un représentant de la famille des Flavobacteriaceae. L'analyse des séquences des ARNr 16S montre que la souche KMM 3516 appartient bien à la famille des Flavobacteriaceae. Toutefois, les homologies de séquence avec les espèces les plus proches ( Arenibacter latericius, Muricauda ruestringensis, Zobellia galactanivorans et Zobellia uliginosa) ne dépassent pas 90,1 p. cent ce qui justifie la proposition d'un nouveau genre. Le genre Vitellibacter est constitué de bacilles à Gram négatif, immobiles, non sporulés, halophiles, aérobies, produisant un pigment jaune orange non diffusible, synthétisant des flexirubines, chimio-organotrophes, oxydase positive, catalase positive et phosphatase alcaline positive. Outre les caractères du genre Vitellibacter, l'unique souche de Vitellibacter vladivostokensis est constituée de bacilles de 0,3 à 0,5 µm de diamètre sur 3 à 10 µm de longueur, donnant des colonies circulaires, à contour régulier, lisses, convexes, brillantes et d'un diamètre de 2 à 4 mm après culture sur le milieu Marine Agar. Une culture est observée pour des températures comprises entre 4 et 43 °C (température optimale 28 °C) et pour des concentrations en NaCl variant de 1 à 6 p. cent. . Une réponse positive est observée pour les tests dégradation de la gélatine, de la caséine, de l'ADN, de l'élastine du Tween 20 et du Tween 40. . Une réponse négative est notée pour les tests réduction des nitrates, production d'hydrogène sulfuré, indole, uréase, dégradation de la cellulose, de la chitine, de l'agar, de l'amidon, de l'alginate, du Tween 60 et du Tween 80, acidification des sucres, assimilation de l'arabinose, du glucose, de l'inositol, du lactose, du mannitol, du mannose, du saccharose et du sorbitol. . Quelques caractères permettant de différencier le genre Vitellibacter des autres genres de la famille des Flavobacteriaceae sont présentés dans le tableau I. Orientation bibliographique NEDASHKOVSKAYA (O.I.), SUZUKI (M.), VYSOTSKII (M.V.) et MIKHAILOV (V.V.) : Vitellibacter vladivostokensis gen. nov., sp. nov., a new member of the phylum Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2003, 53, 1281-1286. * : Apostichopus (ou Stichopus) japonicus Classification d'après le NCBI Taxonomy Browser : Eukaryota ; Fungi/Metazoa group ; Metazoa ; Eumetazoa ; Bilateria ; Coelomata ; Deuterostomia ; Echinodermata ; Eleutherozoa ; Echinozoa ; Holothuroidea ; Aspidochirotacea ; Aspidochirotida ; Stichopodidae ; Stichopus (ou Apostichopus) ; Stichopus (ou Apostichopus) japonicus. Pour un bref commentaire concernant le nom de genre (Stichopus ou Apostichopus) voir le fichier About the Latin name of the Japanese sea cucumber Le concombre de mer est un aliment très apprécié des asiatiques et notamment des chinois et des japonais. De plus, des travaux scientifiques suggèrent que Apostichopus japonicus pourrait être utilisé pour le traitement de certains cancers (lymphomes, cancers du sein). Au Japon on consomme soit l'animal entier conservé dans du vinaigre ("Sunomono") soit l'animal entier puis séché ("Iriko") soit les intestins coupés en tranches et salés ("Konowata") soit les ovaires séchés ("Konoko"). En Chine, on consomme l'animal séché vendu sous le nom de "Haisheng" (ginseng de mer). Après nettoyage et éviscération, les concombres de mer sont bouillis, salés, puis à nouveau bouillis et enfin séchés au soleil. Compte tenu de son importance, Apostichopus japonicus fait l'objet d'un élevage en Chine, au Japon, aux Indes, en Indonésie, aux Philippines et en République de Corée. La FAO a publié un document très intéressant concernant l'élevage du concombre de mer. Voir, Sea cucumber culture. Pour une photographie de cette espèce, voir Stichopus japonicus sur le site du National Science Museum, Tokyo Retour