Lactobacillus equigenerosi

Créé le 12 juin 2008
Dernière mise à jour le 04 mars 2010

LACTOBACILLUS EQUIGENEROSI

Le genre Lactobacillus* renferme de nombreuses espèces ou sous-espèces (voir le fichier Lactobacillus in List of Procaryotic names with Standing in Nomenclature) associées aux muqueuses de l'homme et de l'animal et jouant un rôle important dans l'industrie agro-alimentaire (ferments, producteurs d'arômes, probiotiques...) ou dans l'industrie pharmaceutique (préparations visant à maintenir ou à restaurer les flores).

La nomenclature de Lactobacillus equigenerosi a été validement publiée le 09 avril 2008 par Endo et al. pour deux souches bactériennes isolées des fèces de chevaux élevés au Japon. L'étude de la flore digestive de chevaux pur sang a permis à ces auteurs d'isoler 35 souches bactériennes. Parmi elles, cinq souches n'ont pu être identifiées. Deux de ces souches, phylogénétiquement apparentées à Lactobacillus gastricus ont été soumises à une étude taxonomique.
Les séquences des ARNr 16S des deux souches présentent 99,9 p. cent de similitude. Les espèces phylogénétiquement les plus proches sont Lactobacillus gastricus, ¤ Lactobacillus mucosae, ¤ Lactobacillus ingluviei et Lactobacillus fermentum. Le pourcentage de similitude obtenu avec l'espèce la plus proche (Lactobacillus gastricus) est de 97,9 alors que les pourcentages de similitude obtenus avec les autres espèces sont inférieurs ou égaux à 95,8. En accord avec les conclusions de Stackebrandt et Goebel le pourcentage de similitude observé avec Lactobacillus gastricus ne permet pas de décrire une nouvelle espèce.
Les résultats des hybridations ADN-ADN montrent (i) que les deux souches isolées de pur sang appartiennent à une même genomospecies (voir le fichier ¤ "Définition d'une genomospecies et d'une espèce bactérienne") et (ii) que cette genomospecies est distincte de Lactobacillus gastricus. En effet, les pourcentages d'homologie obtenus entre la souche DSM 16045 (qui sera désignée comme la souche type de Lactobacillus equigenerosi) et la souche type de Lactobacillus gastricus varient de 18 à 23.
Les caractères phénotypiques permettent de caractériser la genomospecies ce qui autorise la description d'une nouvelle espèce au sein du genre Lactobacillus.

Les souches de Lactobacillus equigenerosi sont constituées de coques ou de cellules ovoïdes à Gram positif, immobiles, non sporulés, de 0,5 à 0,8 µm de diamètre sur 0,8 à 1,5 µm de longueur, se présentant de manière isolée ou groupés par deux ou plus rarement en tétrades, catalase négative et à métabolisme hétérofermentaire strict (la fermentation du glucose conduit à la production d'acide D-lactique, d'acide L-lactique, d'éthanol, d'acide acétique et de dioxyde de carbone). Le type respiratoire est aéro-anaérobie, mais la croissance en bouillon est plus abondante en anaérobiose et après culture sur milieux gélosés des colonies ne sont obtenues qu'après culture en anaérobiose.

. Une réponse positive est obtenue avec les tests acidification du D-fructose (réponse faiblement positive), du D-glucose, du maltose, du mélibiose, du ribose (réponse faiblement positive), du saccharose et du D-xylose.
. Une réponse négative est observée avec les tests réduction des nitrates, acidification de l'amidon, du cellobiose, du D-mannitol, du mélézitose, du L-rhamnose, de la D-salicine, du sorbitol et du tréhalose.
. L'acidification du L-arabinose, du D-galactose, du lactose et du raffinose est variable selon les souches.

Sur gélose MRS^** incubée à 37 °C et en anaérobiose, les colonies sont beiges, lisses et leur diamètre est d'environ 1 à 2 mm après 48 heures d'incubation.
Les souches cultivent facilement à 30 et 45 °C et lentement à 25 °C. Aucune culture n'est observée à 20 ou 50 °C.
Une croissance est observée à pH 4,0ou dans un bouillon MRS contenant 2,5 p. cent de NaCl. En revanche le germe ne croît ni à pH 30 ni en présence de 5,0 p. cent de NaCl.

Une étude réalisée sur neuf chevaux a montré que Lactobacillus equigenerosi, ¤ Lactobacillus equi et ¤ Lactobacillus hayakitensis sont les espèces du genre Lactobacillus les plus abondantes dans l'intestin des chevaux pur-sang élevés au Japon.
L'ingestion d'une souche de Lactobacillus equigenerosi a permis de mettre en évidence un effet probiotique aussi bien chez des rats que chez des chevaux pur-sang.

ENDO (A.), ROOS (S.), SATOH (E.), MORITA (H.) et OKADA (S.) : Lactobacillus equigenerosi sp. nov., a coccoid species isolated from faeces of thoroughbred racehorses. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2008, 58, 914-918.

MORITA (H.), NAKANO (A.), SHIMAZU (M.), TOH (H.), NAKAJIMA (F.), NAGAYAMA (M.), HISAMATSU (S.), KATO (Y.), TAKAGI (M.), TAKAMI (H.), AKITA (H.), MATSUMOTO (M.), MASAOKA (T.) et MURAKAMI (M.) : Lactobacillus hayakitensis, L. equigenerosi and L. equi, predominant lactobacilli in the intestinal flora of healthy thoroughbreds. Anim. Sci. J., 2009, 80, 339–346.

STACKEBRANDT (E.) et GOEBEL (B.M.) : Taxonomic note: A place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 846-849.